Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fbxw18Q3TSA9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms