Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem38aQ3TMP8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms