Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca4Q3TKT4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca4Q3TKT4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms