Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp39Q3TIX9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp39Q3TIX9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms