Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fubp3Q3TIX6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms