Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap5b1Q3TAP4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms