Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Treml4Q3LRV9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Treml4Q3LRV9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Treml4Q3LRV9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms