Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q3KNL4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms