Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb33Q30KN3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms