Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Samd11Q1RNF8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms