Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lrriq3Q14DL3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms