Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ptcd3Q14C51 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptcd3Q14C51 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms