Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PepdQ11136 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PepdQ11136 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PepdQ11136 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PepdQ11136 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PepdQ11136 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PepdQ11136 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PepdQ11136 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PepdQ11136 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PepdQ11136 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PepdQ11136 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PepdQ11136 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PepdQ11136 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PepdQ11136 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms