Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klrb1Q0ZUP1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klrb1Q0ZUP1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms