Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp2b3Q0VF55 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp2b3Q0VF55 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms