Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms