Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps8Q0P5W1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps8Q0P5W1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms