Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TrioQ0KL02 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TrioQ0KL02 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms