Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NeblQ0II04 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NeblQ0II04 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms