Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pate4Q09098 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms