Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
1700061G19RikQ08EE8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
1700061G19RikQ08EE8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms