Protein–RNA interactions for Protein: Q08642

Padi2, Protein-arginine deiminase type-2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi2Q08642 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Padi2Q08642 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Padi2Q08642 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms