Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxc4Q08624 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc4Q08624 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms