Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ebf1Q07802 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ebf1Q07802 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms