Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nfe2Q07279 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms