Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Apoc2Q05020 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Apoc2Q05020 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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