Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk18Q04899 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk18Q04899 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms