Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox12Q04890 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox12Q04890 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms