Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox9Q04887 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox9Q04887 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms