Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sox8Q04886 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox8Q04886 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms