Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Top1Q04750 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Top1Q04750 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms