Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Emx1Q04742 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms