Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CkbQ04447 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CkbQ04447 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CkbQ04447 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms