Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RelaQ04207 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RelaQ04207 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms