Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scg2Q03517 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms