Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs2Q03350 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Thbs2Q03350 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Thbs2Q03350 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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