Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ddr1Q03146 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddr1Q03146 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms