Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mmp11Q02853 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mmp11Q02853 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms