Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfiaQ02780 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms