Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gjb5Q02739 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gjb5Q02739 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms