Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctnnb1Q02248 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms