Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RykQ01887 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RykQ01887 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RykQ01887 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RykQ01887 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms