Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VcpQ01853 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms