Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
EgfrQ01279 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EgfrQ01279 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms