Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pde1bQ01065 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms