Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pde4dQ01063 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pde4dQ01063 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms