Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Serpina1cQ00896 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms