Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms