Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rbp4Q00724 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rbp4Q00724 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms