Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoa1Q00623 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms